IPRCでのCENTOSマシンのセットアップ

と，いってもOSを入れるところはDaveにやってもらったので，
（アメリカではそういう感じで分業が進んでいます）
ソフトウェアのインストールだけです．

1.gcc,emacs,g++をインストール
$ yum -y install gcc
でいけますが，rootでやる必要があります．
rootのパスワードを教えてもらっていなかったので，
$ sudo yum -y install gcc
とする必要があります（スーパーユーザーの権限があればこれでいける）
同様にemacsは
$ sudo yum -y install emacs
g++は
$ sudo yum -y install gcc-c++
です．

2.intel fortran compilerのインストール
http://www.intel.com/cd/software/products/asmo-na/eng/340679.htm
からダウンロード(プロダクトキー：NDXX-4VFCLMNH)
ia32用をダウンロードします．

あとは
$tar -zxvf l_fc_p_10.0.023_ia32.tar.gz
$cd l_fc_p_10.0.023_ia32
$sudo sh ./install.sh
で指示に従っていけばOK．

また、~/.tcshrcに
setenv LD_LIBRARY_PATH "$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/fc/10.0.023/lib"
setenv PATH "$PATH:/opt/intel/fc/10.0.023/bin:/opt/intel/idb/10.0.023/bin"
setenv MANPATH "$MANPATH:/opt/intel/fc/10.0.023/man:/opt/intel/idb/10.0.023/man"
と

setenv INTEL_FLEXLM_LICENSE "/opt/intel/licenses"
setenv FC "ifort"
setenv F90 "ifort"
setenv CXX "g++"
setenv CPPFLAGS "-DNAGf90Fortran"

を加えてください
（ここの設定は
ログイン時に
$ source /opt/intel_fc_80/bin/ifortvars.csh
とやってもよいです）

3.gnuplotのインストール
http://www.gnuplot.info/
からダウンロード
$tar -zxvf gnuplot-4.2.0.tar.gz
$cd gnuplot-4.2.0
$sudo ./configure
$sudo make

4.GrADSのインストール
http://grads.iges.org/grads/grads.html
からダウンロードしてきてください
linux用binariesをダウンロードしてくるのが簡単です
GrADS本体だけでなくdata.tar.Zもダウンロードしてきてください

#GrADS本体のインストールは
grads-1.8sl11-linux.tar.gzを/usr/local（あるいはインストールしたいべつのディレクトリ）において
/usr/localで
$sudo tar -zxvf grads-1.8sl11-linux.tar.gz
とする

#data.tar.Zは
data.tar.Zを/usr/local/lib/grads（あるいはインストールしたい別のディレクトリ）において
$ uncompress data.tar.Z
$ tar xvf data.tar
とする

#ftp://grads.iges.org/grads/scrptsからgsファイルをコピーして，
/usr/local/lib/grads（あるいはインストールしたい別のディレクトリ）
にコピーする．

#.basrcに
setenv PATH "/usr/local/grads/bin:$PATH"
(GrADS本体を入れたディレクトリ)
setenv GADDIR "/usr/local/lib/grads"
(data.tar.Zの中身を入れたディレクトリ)
setenv GASCRP "/usr/local/lib/grads"
(スクリプトを入れたディレクトリ)
を書き加えてください


5.NetCDF(ver 3.6.2)のインストール
http://my.unidata.ucar.edu/content/software/netcdf/index.html
からnetcdf.tar.gzをダウンロード

$ tar -zxvf netcdf.tar
$ cd netcdf-3.6.2
$ ./configure --prefix=/usr/local/netcdf
$ sudo make check
$ sudo make 
$ sudo make install
という感じ
この場合，/usr/local/netcdfというディレクトリは予め
作っておいてください．

#intel fortran compilerのところで.bashrcをちゃんと設定していないとうまくいきません

また、~/.tcshrcに
setenv PATH "$PATH:/usr/local/netcdf/bin"
setenv MANPATH "$MANPATH:/usr/local/netcdf/man"
setenv LD_LIBRARY_PATH "$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/netcdf/lib"

setenv NETCDFHOME "/usr/local/netcdf"

を加えてください



6.HDF(4.2)のインストール
http://hdf.ncsa.uiuc.edu/hdf4.htmlから
4.2r1-linux.tar.gz
zlib121-linux2.4.tar.gz
szip2.0-linux-enc.tar.gzをダウンロード

$ tar -zxvf 4.2r1-linux.tar.gz
この場合，/usr/local/hdf4.2r1というディレクトリを作っておいて，
そこへ解凍した中身をコピーする．
（/usr/local/hdf4.2r1/binに実行ファイルがくるように）

$ tar -zxvf zlib121-linux2.4.tar.gz
$ tar -zxvf zlib121-linux2.4.tar.gz
として，~/zlib21-linux2.4/libや~/zlib21-linux2.4/include等を
/usr/local/hdf4.2r1/libや/usr/local/hdf4.2r1/include等にコピーする．

また、~/.tcshrcに
setenv LD_LIBRARY_PATH "$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/hdf4.2r1/lib"
setenv PATH "$PATH:/usr/local/hdf4.2r1/bin"
setenv MANPATH "$MANPATH:/usr/local/hdf4.2r1/man"
を加えてください．


7.gfortranのインストール
どうやらtheme3ではgfortranを使っているようなので，
こちらもインストール

.tcshrcのifortに関係する部分は#でコメントアウトしておく．

http://gcc.gnu.org/wiki/CFortran
からlinux用のバイナリをダウンロード

$ tar -zxvf gfortran-linux.tar.gz
できたディレクトリを/usr/local等に置く
$ sudo mv irun /usr/local/

また，~/.tcshrcに
setenv LD_LIBRARY_PATH "/usr/local/irun/lib:$LD_LIBRARY_PATH"
setenv PATH "/usr/local/irun/bin:$PATH"
setenv MANPATH "/usr/local/irun/man:$MANPATH"
を加えてください．



他のホストにリモートログインして
Xウィンドウを表示させる

１．
/etc/X11/gdm/gdm.confのDisallowTCP=trueと書いてある行の
先頭にある#を削除
２．
trueをfalseと書き換えて保存
３．
reboot